宝可梦培育是指通过生蛋孵化获得新的宝可梦的方式来获得玩家想要的宝可梦，同时兼指对宝可梦能力的培养。培养宝可梦一般是为了获得在对战中最符合其能力的强大的宝可梦。
培育规则
通常情况下，培育需要两只玩家PC1.12或同行队伍1.16起内的同蛋群不同性别的宝可梦。在牧场方块1.12或培育屋1.16起内进行选择后，父母双方若是符合培育规则便会开始繁衍后代。持续一段时间1.12或满足培育需求1.16起之后将会生下一颗母方进化链中幼年宝可梦的蛋。例如喷火龙♂与妙蛙花♀培育之后生下来的将会是妙蛙种子的蛋。
特殊情况
百变怪可以与未发现蛋群以外的任何一只宝可梦进行培育，不论性别。生下来的会是百变怪以外的一方在进化链中幼年宝可梦的蛋。例如仙子伊布♂与百变怪培育之后生下来的将会是伊布的蛋。
百变怪可以与百变怪进行培育，培育出来的是除传说宝可梦以外（默认配置下）随机一只宝可梦的蛋。（此处和原作游戏并不相同，算是彩蛋玩法）
如果母方为尼多兰，或者是百变怪与尼多王进化链中的任意一员进行培育，培育出来的蛋将会是尼多兰或尼多朗中的随机一个。
如果母方为甜甜萤，或者是百变怪与电萤虫进行培育，培育出来的蛋将会是甜甜萤或电萤虫中的随机一个。
如果百变怪与玛纳霏进行培育，培育出来的将会是霏欧纳的蛋。
一部分宝可梦培育之后生下来的并不会是进化链中的幼年宝可梦，需要母方携带对应的熏香才可以生出幼年宝可梦。具体如下表所示：
母方宝可梦所需熏香子代宝可梦玛力露/玛力露丽海潮薰香露力丽果然翁悠闲薰香小果然毒蔷薇/罗丝雷朵花朵薰香含羞苞风铃铃洁净薰香铃铛响树才怪岩石薰香盆才怪魔墙人偶奇异薰香魔尼尼吉利蛋/幸福蛋幸运薰香小福蛋卡比兽饱腹薰香小卡比兽巨翅飞鱼涟漪薰香小球飞鱼
培育屋培育过程
与培育屋交互可以将同行队伍中的宝可梦放入，如果符合上述规则，点击培育屋中的“√”就会将宝可梦置入并开始培育。最多可以同时培育三对宝可梦。
培育过程需要等待相当长的时间，并且需要满足宝可梦产生的需求。时间和需求物品都取决于宝可梦的第一属性，如果亲代双方的宝可梦都是相同属性，那么只需要90分钟和一种属性的物品。如果不同，则需要180分钟和两种属性的物品。具体需求物品如下表所示：
虫恶龙电妖精格斗2x 蒲公英
3x 蜘蛛网
3x 蜘蛛眼
2x 煤炭块
1x 骷髅头颅
1x 黑曜石
1x 钻石块
2x 金块
3x 末地石
2x 红石块
3x 荧石
2x 红石灯
1x 蛋糕
3x 铃兰
3x 紫颂果
3x 橡木木板
2x 红砖块
2x 神社砖
火飞行幽灵草地面冰5x 打火石
2x 熔岩桶
2x 烈焰棒
10x 羽毛
3x 玻璃
3x 标靶
10x 恶魂之泪
3x 灵魂火把
3x 灵魂沙
5x 高草丛
3x 橡树树叶
3x 草方块
3x 黏土
3x 棕色陶瓦
3x 灵魂土
10x 冰
1x 蓝冰
5x 雪块
一般毒超能力岩石钢水10x 皮革
3x 干草捆
3x 白色羊毛
1x 酿造台
3x 菌丝体
3x 黏液块
5x 末影之眼
3x 书架
2x 时钟
5x 巨石
5x 花岗岩
10x 石头
3x 铁块
3x 铁栏杆
2x 银块
3x 海龟鳞甲
2x 水桶
5x 美味之水
完成上述需求并等到时间结束后，宝可梦就会产下一颗蛋。已完成的培育日志可以在生存模式物品栏的培育屋标签页查看。
培育期间，使用Isi的钻石沙漏可以完成培育屋中三个盒子的所有需求和所需时间并给予他们完美个体，最大亲密度，以及一个奖章；使用Isi的金沙漏可以完成培育屋中一个盒子的所有需求和所需时间；使用Isi的银沙漏可以跳过培育屋中宝可梦所需时间的四分之一；使用Isi的铜沙漏可以跳过培育屋中宝可梦的一项需求。
此外，在村庄的培育屋内还有一本由Isi所著的《Your Day Care and You你的培育屋和你》记载了培育屋的基本操作，但是由于只有英文版，导致很少有中文玩家在游戏内仔细读过。
牧场方块培育过程
【!】过时内容提醒：这部分内容仅适用于8.4.3及以前的版本【!】
在1.16.5以及更新的版本中牧场方块已被重置为全新的培育屋系统。
环境满意度
在牧场方块内选择好进行培育的宝可梦之后，还要同时满足双方的环境满意度才可以继续进行培育，否则会使培育进度停滞甚至是倒退。
牧场方块会检测范围内方块能否提供环境满意度，并且根据算法得出该牧场提供的满意度是多少，这个数值决定了进行培育时的强度等级，而强度等级又会影响到培育需要的时间。
只有一部分方块可以给某个属性提供满意度，不同方块提供的满意度数值还会不同，具体见下表
属性\满意度+1+2+3+4一般泥土、草方块、石头栅栏、羊毛蛋糕-格斗沙砾铁砧、铁砧（宝可梦）、砖块、砖楼梯、神社石砖、神社石砖楼梯石砖、錾制石砖、裂纹石砖、苔石砖-飞行草方块玻璃、染色玻璃、染色玻璃板、音符盒、唱片机信标、发射器-毒草方块、棕色蘑菇蜘蛛网、红色蘑菇、棕色蘑菇方块、菌丝、海绵酿造台、红色蘑菇方块-地面沙子、灵魂沙仙人掌、黏土块、陶瓦、砂岩染色陶瓦基岩岩石圆石、石头熔炉、火把、化石基岩、煤炭块、末地石-虫草方块、树叶、原木花、棕色蘑菇方块花盆、红色蘑菇方块-幽灵苔石床、蜘蛛网、菌丝绿宝石块、书架、地毯、铁栏杆、唱片机、生物头颅-钢铁轨、石头探测铁轨、铁栏杆、铁门、活塞金块、铁块-火石头、原木熔岩、地狱岩、火把火-水水海绵、甘蔗、水之石矿睡莲、海晶灯-草草、蕨、草方块、枯木西瓜种子、南瓜种子、青苔岩胡萝卜、小麦种子、南瓜、西瓜、南瓜灯-电铁轨、红石灯（暗）激活铁轨、红石块、红石矿石PC机、红石灯（亮）-超能力地毯告示牌、书架钻石块、绿宝石块、石英块、附魔台-冰雪冰、冰岩、雪块蓝冰、海晶石砖-龙石头金块、荧石钻石块、绿宝石块、附魔台、末地石龙蛋恶沙子蜘蛛网、下界砖块、黑曜石、灵魂沙煤炭块生物头颅妖精地毯荧石、羊毛蛋糕-
对应属性满意度的总和会被用于计算培育强度，如果是双属性宝可梦则会取双属性强度的平均值。对牧场内的宝可梦右键会根据满意程度查询对应宝可梦目前的培育情况并且以系统信息的方式出现在聊天框内。
满意度和培育强度的关系如下图所示（数据来自于官方wiki）
满意度培育强度显示信息培育过程的持续时间每个培育阶段的持续时间＜350"宝可梦1 好像暗恋 宝可梦2，但是在这个环境下感觉浑身不自在！"无限-30分钟35-690.5"宝可梦1 看上去有点喜欢 宝可梦2 呢！"2小时30分钟30分钟70-1041"宝可梦1 看上去更加受 宝可梦2 喜欢了呢！"1小时15分钟15分钟105-1391.5"宝可梦1 看上去已经获得了 宝可梦2 的爱呢！"50分钟10分钟＞1392"宝可梦1 和 宝可梦2 正在热恋当中呢！"37分钟30秒7分钟30秒
培育阶段
培育过程一共有6个阶段，以不同颜色的心显示，可以视为培育进度。使用Isi的银色沙漏或Isi的金色沙漏可以直接进入下一阶段，具体如下表
培育阶段012345（结束）爱心的颜色没有灰色紫色蓝色黄色红色
孵蛋
要想让蛋孵化，玩家需要携带着蛋走过特定步数，总步数取决于蛋中宝可梦的种类和配置中的"stepsPerEggCycle"。
队伍中如果存在火焰之躯，熔岩铠甲置于队伍首位或蒸汽机特性的宝可梦，孵蛋速度会提高为原来的两倍。但是多个特性不能叠加，最多只能发挥一种特性的效果。
孵蛋每20刻结算一次步数，每次走过步数 = 绝对值（上次结算时x坐标 - 现在的x坐标）+ 绝对值（上次结算时z坐标-现在的z坐标）。要注意的是，如果单次步数>20，则算作0待确认。
遗传
参与培育的父母双方宝可梦会有一部分数值遗传给子代。
个体值
一般情况下，父母双方会有随机的3项不同类的个体值遗传给子代。
如果有任意一方携带了力量类道具（力量负重、力量护腕、力量腰带、力量镜、力量束带、力量护踝），那么遗传给子代的个体值里会有对应力量类道具的一项遗传自携带者，如果双方携带了相同的力量类道具，那么子代的此类个体值会随机遗传自一方。俗称锁个体
如果有任意一方携带了红线，那么随机3项不同类的个体值会被增加到随机5项。
性格
一般情况下，性格是无法遗传的，生出来的子代都会是随机性格。
如果有任意一方携带了不变之石，那么子代的性格会和携带方的性格一致，如果双方都携带了不变之石，那么子代的性格会随机遗传自一方。
蛋招式
如果参与培育的宝可梦有学习特定的可以被遗传的招式，那么子代有可能也会学会该招式。
如果其父方或母方之中的任何一方（或者父母均）学习了某些其种族特有的“蛋招式”，它们的子代就会继承这些招式。这些招式中的大多数都无法通过除了该方式外的其他方式让宝可梦学会。
如果父方学习了任何可通过招式学习器或秘传学习器习得的招式，并且其后代也可正常通过招式学习器/秘传学习器习得这些招式，那么后代便会继承其父方的这些招式。
如果母方和父方都习得了其后代升级能够习得的招式池内的招式，它们的后代便会继承这些招式。这种方式会造成子代能够习得其通常要达到更高等级才能习得的招式。
若一只宝可梦想要学会一个蛋招式，可以让他留出一个技能空槽，并携带模仿香草，之后把任意一只已经学会该技能的宝可梦（不是同蛋群也可以，性别也任意。)和它放入白色培育屋的左右两个槽中，再取出，想学会该蛋招式的宝可梦即可学会。
当亲代任意一方携带电气球培育时，孵化出的皮丘将学会伏特攻击。
如果超过4种招式满足上述原则，那么子代宝可梦会拥有的招式就取决于由上述列表产生的层次结构。也就是说，蛋招式的优先度大于其他原则。如果有超过4种蛋招式可能会被继承，那么母方的蛋招式将会优先继承。
特性
如果参与培育的母方宝可梦是普通特性的话，那么子代有80%的概率会遗传母方宝可梦的特性。
如果参与培育的母方宝可梦是隐藏特性的话，那么子代有60%的概率会遗传母方宝可梦的特性。
如果参与培育的母方宝可梦不是隐藏特性的话，那么子代绝对不会是隐藏特性。
如果参与培育的是父方宝可梦与百变怪的话，那么子代有60%的概率遗传父方宝可梦的特性。
拥有特殊特性的宝可梦（例如牵绊变身的甲贺忍蛙）绝对不会遗传特殊特性，甚至是无法生育。
体型
子代宝可梦的体型会是父母方体型之间的体型，会被随机因素影响而变为与原目标体型相邻的体型，另外巨大体型和袖珍体型只可以通过父母方皆为庞大体型和皆为迷你体型的情况才会出现。极巨化巨大体型吼鲸王警告
宝可梦球
如果两只同种类的宝可梦进行培育（无视其形态差异），那么蛋将会有相等的概率继承其父方或母方宝可梦的宝可梦球球种。否则，母方的宝可梦球球种将会遗传给其后代。除非母方球种为大师球或贵重球。
在无性培育中，如果处于牧场方块右侧槽位的宝可梦拥有可以遗传的球种，那么蛋将会继承相应的精灵球球种。否则，后代将会继承左侧槽位宝可梦所拥有的球种。
地区形态相关
如果父母双方皆为地区形态，那么子代必定为地区形态。
如果母方为地区形态，父方为普通形态，那么子代有50%概率为地区形态。
如果是地区形态宝可梦与百变怪进行培育，那么子代有25%概率为地区形态。
当地区形态的宝可梦A与普通形态的宝可梦B进行培育，那么子代只可能是地区形态的宝可梦A、普通形态的宝可梦A和普通形态的宝可梦B，不可能是地区形态的宝可梦B。
地区形态宝可梦绝不可能把自己的特性遗传给非地区形态的子代，除此之外遵循特性遗传规则。
普通形态的宝可梦也不可能把自己的特性遗传给地区形态的子代。
异色相关
异色宝可梦并不会根据父母是否为异色有影响概率，但受到闪耀护符的加成。
若两只宝可梦的初始训练家不同，则培育出异色宝可梦的概率变为原来的6倍，和闪耀护符叠加最高可得到(1/4096)*6*3≈0.44%的概率出现异色宝可梦。